陽泉市熱啟動Taq酶應(yīng)用領(lǐng)域
發(fā)布時間:2025-06-08 00:55:06
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動物檢疫的分類:根據(jù)我國現(xiàn)行的動物檢疫法律規(guī)定,我國動物檢疫分為進(jìn)出境檢疫和國內(nèi).檢疫兩大類。①進(jìn)出境動物檢疫。是指對進(jìn)出我國國境的動物、動物產(chǎn)品,由口岸動植物檢疫機關(guān)實施的檢疫。具體分為:進(jìn)境動物、動物產(chǎn)品檢疫;出境動物、動物產(chǎn)品檢疫;過境動物、動物產(chǎn)品檢疫;②國內(nèi)檢疫。指對國內(nèi)流動的動物、動物產(chǎn)品所進(jìn)行的檢疫。具體劃分為:產(chǎn)地檢疫、屠宰檢疫、動物產(chǎn)品檢疫。

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常規(guī)普通PCR常見問題:1. 優(yōu)化反應(yīng)條件,梯度摸索退火溫度,延長退火延伸時間,增加反應(yīng)循環(huán)數(shù)(30-45區(qū)間為宜)。2. 對核酸模板進(jìn)行純化,或使用商業(yè)化核酸提取試劑盒進(jìn)行提取,增加核酸模板的上樣量。3. 優(yōu)化反應(yīng)體系(預(yù)混體系除外),改變檢測體系中的Mg2+濃度及dNTPs用量,更換體系中Buffer。4. 重新設(shè)計引物,避免引物二聚體和鏈內(nèi)二級結(jié)構(gòu),在一次稀釋引物后可分裝成多支小管,減少反復(fù)凍融次數(shù)。

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熱啟動PCR(hot start PCR)是指使Taq DNA 聚合酶只有在樣品溫度至少超過70℃時才發(fā)揮作用的PCR,可提高反應(yīng)的特異性。Taq DNA 聚合酶通常在比適宜溫度低得多的條件下仍有較強的活性。PCR 反應(yīng)的初加熱過程中,樣品溫度上升到70℃之前,在較低的溫度下引物可能與部分單鏈模板形成非特異性結(jié)合,并在Taq DNA 聚合酶的作用下延伸。結(jié)果會導(dǎo)致非靶序列的擴(kuò)增,影響反應(yīng)的特異性。熱啟動可減少非靶序列的擴(kuò)增,提高反應(yīng)的特異性。在引物設(shè)計時如果某位點因為遺傳元件的定位而受限,如site-directed 突變、表達(dá)克隆或用于DNA 工程的遺傳元件的構(gòu)建和操作等情況,熱啟動PCR 尤為有效。

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Taq酶的酶動力與擴(kuò)增效率有關(guān)。一般熱啟動Taq酶的酶動力越強,PCR擴(kuò)增的指數(shù)增長期越長,‘S型’曲線更加典型,熒光信號值更高,而且更適合做多重PCR檢測。我們曾比較過多家公司的熱啟動Taq酶,在國外品牌中,英國Bioline公司的熱啟動Taq酶,酶動力較好,可做4重PCR,等量起始模板CT30時的熒光信號值高。在國內(nèi)品牌中,BIOG熱啟動Taq酶的指數(shù)期較長,可做3重PCR,且擴(kuò)增曲線的‘S’型不受影響,其它的國產(chǎn)品牌一般只能支持2重反應(yīng),在做3重反應(yīng)時,擴(kuò)增曲線低矮,熒光信號值較低,無典型擴(kuò)增曲線,結(jié)果很難判定。

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熱啟動通過抑 制一種基本成分延遲DNA合成,直到PCR 儀達(dá)到變性溫度。延緩加入Taq DNA 聚合酶的手工熱啟動方法十分煩瑣,尤其是對高通量應(yīng)用。其他熱啟動方法使用蠟防護(hù)層將一種基本成分(鎂離子、酶、模板、緩沖液等) 隔離開。在熱循環(huán)時,蠟熔化把各種成分釋放出來并混在一起。蠟防護(hù)層法同樣比較煩瑣,易于污染,不適用于高通量應(yīng)用。

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在PCR反應(yīng)早期,產(chǎn)生熒光的水平不能與背景明顯地區(qū)別,而后熒光的產(chǎn)生進(jìn)入指數(shù)期、線性期和終的平臺期,因此可以在PCR反應(yīng)處于指數(shù)期的某一點 上來檢測PCR產(chǎn)物的量,并且由此來推斷模板初的含量。為了便于對所檢測樣本進(jìn)行比較,在real-time Q-PCR反應(yīng)的指數(shù)期,首先需設(shè)定一定熒光信號的域值,一般這個域值(threshold)是以PCR反應(yīng)的前15個循環(huán)的熒光信號作為熒光本底信號 (baseline),熒光域值的缺省設(shè)置是3~15個循環(huán)的熒光信號的標(biāo)準(zhǔn)偏差的10倍。如果檢測到熒光信號超過域值被認(rèn)為是真 正的信號,它可用于定義 樣本的域值循環(huán)數(shù)(Ct)。Ct值的含義是:每個反應(yīng)管內(nèi)的熒光信號達(dá)到設(shè)定的域值時所經(jīng)歷的循環(huán)數(shù)。研究表明,每個模板的Ct值與該模板的起始拷貝數(shù)的 對數(shù)存在線性關(guān)系,起始拷貝數(shù)越多,Ct值越小。利用已知起始拷貝數(shù)的標(biāo)準(zhǔn)品可作出標(biāo)準(zhǔn)曲線,因此只要獲得未知樣品的Ct值,即可從標(biāo)準(zhǔn)曲線上計算出該樣 品的起始拷貝數(shù)。